YouBike不斷新設站點，使用人次也節節攀升，而實際走訪使用率高的文山區師大公館校區後，平均八位使用者中，高達六位對於YouBike的記點制度毫不知情。
YouBike違規記點制度於民國103年2月正式上路，其規範事項包括：行駛騎樓、未禮讓行人、在車道上逆向行駛、附載人員等。其中，又以「未在指定地點騎車」為違規第一名。違規一次記一點，累計達三點停權二周、累計達五點停權二個月、累計達七點取消會員資格。廖姓民眾一聽到YouBike有推行記點制度，驚訝直呼：「記什麼點啊？我都不知道，他沒有宣導啊。」
文山區名列台北市「超難借車行政區排行榜」前三名，而高使用率也為文山區居民帶來了潛在的危險。廖姓民眾認為，YouBike的安全疑慮在於騎在人行道上可能會撞到路人。YouBike騎士邱澤明則說，記點可以讓YouBike變得更有秩序，應該加強宣導。帶著孫女出門散步的詹姓民眾對於YouBike騎在小公園感到非常危險，認為若有相關規範的話會更好，但他卻不知道YouBike已有記點制度。
交通局交通治理科科長劉嘉祐回應，此制度自去年開始推動，持續至今。在當初的規畫上，是透過交通助理員，選擇民眾抱怨較多的違規地點執行。而記點的主要用意是達到交通安全宣導的效果。宣導則是在實施之初透過網站公告、會員電子報及召開記者會宣傳等。記點制度立意良好，但在民眾毫不知情的狀況下實難以發揮效果。
